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据阿根廷媒体报道，目前已有多个新冠病毒变种的刺突蛋白发生结构性变化，也就是说，病毒正在不断变异，据统计，4种新冠病毒变种严重威胁人类，它们分别是发现于印度的德尔塔，发现于英国的阿尔法，发现于巴西的伽马，以及发现于南非的贝塔。
1Alpha阿尔法变异毒株
2020年末在英国首次发现。该变异株含有超过十几种突变，一些突变位于刺突蛋白。变异的主要特征是强化了传播性，毒性似乎也有增强，但并不是很突出。另一种突变是刺突蛋白氨基酸69-70缺失。存在此缺失时，一些新冠病毒的分子检测不能检出编码刺突蛋白靶点。这可能导致漏诊。
2Beta新冠变异毒株
2020年末在南非发现。该变异病毒株存在刺突蛋白的另一种突变。
新冠病毒不断变异
最先是从几个日本到巴西旅行返回后的游客测出，在2020年12月于巴西亚马逊州测序的31份样本中，42%发现此变异株感染。Gamma有几种突变，包括位于刺突蛋白受体结合结构域的3种突变，因此有人认为其可能会增加传播率和影响免疫力。
4Delta德尔塔变异毒株
于2020年12月在印度首次发现，该变异可能是到2022年8月4日为止最强传播性的新冠病毒变异株，而且其重症概率更高。在今年广州疫情期间研究发现Delta的初始呼吸道病毒RNA水平比在大流行第一阶段传播的祖先病毒高1260倍。目前我国南京新一轮也是由此变异病毒引起。
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